Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RCC1P18754 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms