Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XBP1P17861 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XBP1P17861 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.33■■□□□ 1
XBP1P17861 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XBP1P17861 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XBP1P17861 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XBP1P17861 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XBP1P17861 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XBP1P17861 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XBP1P17861 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms