Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DESP17661 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DESP17661 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DESP17661 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DESP17661 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DESP17661 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DESP17661 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DESP17661 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DESP17661 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DESP17661 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms