Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms