Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA2P17301 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms