Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZKSCAN1P17029 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms