Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms