Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms