Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRF1P14222 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms