Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms