Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms