Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MS4A1P11836 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A1P11836 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms