Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOP1P11387 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOP1P11387 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP1P11387 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms