Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms