Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms