Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1RP07333 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms