Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms