Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYF2O95926 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms