Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP4K4O95819 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms