Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DYSFO75923 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms