Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP4O75379 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms