Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms