Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GMDSO60547 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GMDSO60547 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms