Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms