Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms