Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms