Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASKO14936 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASKO14936 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASKO14936 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASKO14936 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASKO14936 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASKO14936 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms