Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APAF1O14727 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APAF1O14727 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APAF1O14727 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APAF1O14727 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APAF1O14727 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms