Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms