Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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