Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms