Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms