Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms