Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms