Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC78A2IDD5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms