Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFE2L3Q9Y4A8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms