Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms