Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms