Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms