Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms