Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms