Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS3Q9UNS2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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