Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms