Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNRGQ9UMZ2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms