Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALKQ9UM73 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKQ9UM73 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms