Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PADI1Q9ULC6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms