Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms