Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms