Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms