Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms